1 -5-3- سیگار……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………10

 

1-5-4- فاکتورهای ژنتیکی…………………………………………………………………………………………………………………………………………11

 

1-6- مخاط معده…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….12

 

1-7- موکوس معده…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………12

 

1-8- پروتئین های گاستروکین …………………………………………………………………………………………………………………………………….13

 

1-8-1- ژن GKN1 …………………………………………………………………………………………………………………………………………………….15

 

1-8-2-نقش GKN1 در معده و سرطان معده…………………………………………………………………………………………………………..16

 

1-9- ارتباط پلی مورفیسم‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌ ژنتیکی با خطر ابتلا به سرطان…………………………………………………………………………………..18

 

1-10- اهداف تحقیق…………………………………………………………………………………………………………………………………………………….20

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

فصل دوم:پیشینه تحقیق

 

فصل سوم:مواد و روش ها

 

3-1- وسایل و مواد مورد استفاده در این مطالعه…………………………………………………………………………………………………………..24

 

3-2- نوع مطالعه……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..26

 

3-3- جامعه آماری و نمونه گیری………………………………………………………………………………………………………………… ………………26

 

3-4- رضایت نامه…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….27

 

3-5- روش تهیه محلول‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌ مورد نیاز جهت انجام الکتروفورز……………………………………………………………………………………..27

 

3-5-1-روش تهیه بافر الکتروفورز TBE در حجم 500 میلی لیتر……………………………………………………………………………..27

 

3-5-2- محلول رنگ آمیزی DNA Stain ………………………………………………………………………………………………………………….28

 

3-6- استخراج DNA از خون………………………………………………………………………………………………………………………………………….28

 

3-7- تهیه ژل آگارز و الکتروفورز…………………………………………………………………………………………………………………………………….29

 

3-8- طراحی پرایمر…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………30

 

3-9- تکثیر ناحیه پروموتری ژن GKN1……………………………………………………………..………………………………………………………. 31

 

3-10- توالی یابی……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..35

 

3-11- شناسایی SNPهای پروموتر ژن GKN1 …………………………………………………………………………………………………………….35

 

3-12- تکنیک  Tetra Primer ARMS- PCR………………………………………………………………………………………………………………..35

 

3-13- تعیین ژنوتیپ  SNP با شناسه های rs4575760  و rs4072127 با روش Tetra- primer ARMS PCR…………37

 

3-14- آنالیز آماری………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….42

 

پرسشنامه………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….43

 

فصل چهارم-نتایج

 

4-1- مشخصات جمعیت مورد مطالعه…………………………………………………………………………………………………………………………44

 

4-2- بررسی ارتباط فاکتورهای خطر با سرطان معده………………………………………………………………………………………………….47

 

4-2-1- عفونت هلیکوباکتر پیلوری…………………………………………………………………………………………………………………………..47

 

4-2-2- مصرف الکل…………………………………………………………………………………………………………………………………………………..48

 

4-2-3- ازدواج فامیلی والدین……………………………………………………………………………………………………………………………………49

 

4-2-4- سابقه سرطان در خانواذه……………………………………………………………………………………………………………………………..51

 

4-3- بررسی کیفیت DNA استخراج شده…………………………………………………………………………………………………………………..51

 

4-4- تکثیر ناحیه پروموتری ژن‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌ GKN1……………………………………………………………………………………………………………………..52

 

4-5- شناساییSNP  های ناحیه پروموتری ژن GKN1………………………………………………………………………………………………53

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

4-6- تعیین ژنوتیپ  SNPبا شناسه‌های rs4575760 وrs4072127  با تکنیک Tetra Primer ARMS- PCR………55

 

4-7- بررسی ارتباط پلی مورفیسم rs 4575760  ژنGKN1  با خطر ابتلا به سرطان معده……………………………………….58

 

4-8– بررسی ارتباط پلی مورفیسم rs 4072127 ژن GKN1 با خطر ابتلا به سرطان معده……………………………………….58

مقالات و پایان نامه ارشد

 

4-9- بررسی ارتباط پلی مورفیسم‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌ ژنGKN1   با نوع تومور………………………………………………………………………………..60

 

فصل پنجم-بحث و نتیجه گیری

 

5-1- عوامل موثر در ابتلا به سرطان معده…………………………………………………………………………………………………………………62

 

5-1-1- بررسی نتایج حاصل از اثر عفونت هلیکوباکتر پیلوری بر ابتلا به سرطان معده………………………………………….63

 

5-1-2- بررسی نتایج حاصل از تاثیر الکل با خطر ابتلا به سرطان معده…………………………………………………………………63

 

5-1-3- سابقه سرطان در خانواده (اقوام درجه یک)……………………………………………………………………………………………….64

 

5-1-4- نتایج حاصل از بررسی ارتباط پلی مورفیسم‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌ تک نوکلئوتیدی پروموتر ژن GKN1 با خطر ابتلا به سرطان

 

معده………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………65

 

پیشنهادات………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………67

 

رفرنس…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….68

 

چکیده خارجی……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….78

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

فهرست شکل ها

 

شکل 1-1-قسمت‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌ مختلف معده……………………………………………………………………………………………………………………………..4

 

شکل 1- 2- ترکیبات تشکیل دهنده موکوس……………………………………………………………………………………………………………..12

 

شکل1 – 3- ساختار فضایی پروتئین های گاستروکین……………………………………………………………………………………………….14

 

شکل 1-4- بیان GKNS، TFFS و موسین‌ها در اپیتلیوم معده موش………………………………………………………………………….14

 

شکل 1-5- جایگاه ژن‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌ GKN1، GKN2 و GKN3 بر روی کروموزوم 2 انسان…………………………………………………..15

 

شکل 1-6- موقعیت 38CYS در 3 ژنGKN1، GKN2 و GKN3……………………………………………………………………………16

 

شکل 3-1: نمایی از تکنیک Tetra Primer ARMS- PCR……………………………………………………………………………………….36

 

شکل 4-1: الکتروفورز DNA استخراج شده بر روی ژل آگارز 1 درصد. …………………………………………………………………..51

 

شکل 4-2:   تکثیر بخشی از ناحیه پروموتری ژن GKN1 (GKN1A)……………………………………………………………………..52

 

شکل 4-3: تکثیر بخشی از ناحیه پروموتری ژن GKN1 (GKN1B)………………………………………………………………………..53

 

شکل 4-4 : مقایسه توالی ناحیه پروموتر ژن GKN1 با نرم افزار SeqMan ………………………………………………………………54

 

شکل 4-5: ژنوتیپ‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌ مختلف در SNP  rs 4557760 در پروموتر ژن GKN1………………………………………………………..54

 

شکل4-6 :ژنوتیپ‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌ مختلف در SNP 72127  rs 40 در پروموتر ژن GKN1 ……………………………………………………….55

 

شکل4-7: تعیین ژنوتیپ SNP با شناسه 4557760  rs ژن GKN1 با تکنیک Tetra Primer ARMS- PCR………..56

 

شکل4- 8: تعیین ژنوتیپ SNP با شناسه 4072127  rsژن GKN1 با تکنیک  .Tetra Primer ARMS- PCR………57

 

شکل 5-1: نواحی پروموتری ژن‌های GKN2، TFF1، TFF2 و TFF3 و فاکتورهای رونویسی مربوط به این ژن‌ها….67

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

فهرست جداول

 

جدول 1-1– خلاصه ای از پلی مورفیسم‌ها‌یی که با انواع منتشر و روده ای سرطان معده در ارتباط هستند……………19

 

جدول 3-1- توالی پرایمرهای GKN1A و GKN1B…………………………………………………………………………………………………….32

 

جدول 3-2- شرایط PCR جهت تکثیر ناحیه پروموتری ژن GKN1 (GKN1A و GKN1B )…………………………………..33

 

جدول 3-3- میزان مواد مورد نیاز PCR جهت تکثیر ناحیه پروموتری ژن GKN1…………………………………………………….34

 

جدول 3-5- توالی پرایمرهای مورد استفاده در Tetra- primer ARMS PCR برای تعیین ژنوتیپ rs4575760……..37

 

جدول 3-6- توالی پرایمرهای مورد استفاده در Tetra- primer ARMS PCR برای تعیین ژنوتیپ rs4072127……..38

 

جدول 3-7- مواد و حجم مورد نیاز برای انجام Tetra- primer ARMS PCR  برای تعیین ژنوتیپrs 4575760 ……39           جدول 3-8- مواد و حجم مورد نیاز برای انجام Tetra- primer ARMS PCR  برای تعیین ژنوتیپ rs 4072127 ….40          جدول3-9- شرایط PCR برای تعیین ژنوتیپ rs4575760…………………………….. …………………………..41       جدول3-10- شرایط PCR برای تعیین ژنوتیپ rs4072127………………………………………………………………………………………41        جدول4-1: مشخصات نمونه‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های جمعیت A……………………………………………………………………………………………………………….45

 

جدول4-2: مشخصات نمونه‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌ جمعیت B……………………………………………………………………………………………………………….46

 

جدول 4-3: ژنوتیپ نمونه‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌ بیمار و شاهد پلی‌مورفیسم rs 4557760 ………………………………………………………………….59

 

جدول 4-4: ژنوتیپ نمونه‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌های‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌‌ بیمار و شاهد پلی مورفیسم rs 4072127 ………………………………………………………………..59

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

فهرست نمودارها

 

نمودار4-1- فراوانی سرطان های Intestinal (19 نفر)و diffuse (12 نفر) در بیماران آلوده به هلیکوباکتر پیلوری در

 

جمعیت A……………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………..47

 

نمودار 4-2- فراوانی سرطان های Intestinal (17 نفر) و diffuse (11 نفر) در مبتلایان به هلیکوباکتر پیلوریدر

 

جمعیت B…………………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….48

 

نمودار4-3: فراوانی افراد الکلی و غیر الکلی در گروه بیمار و شاهد در جمعیت A……………………………………………………49

 

موضوعات: بدون موضوع  لینک ثابت


فرم در حال بارگذاری ...