2-8-3   گرگور مندل  ……………………………………………………………………………………………..17

 

2-8-4   نظریۀ ترکیبی انتخاب طبیعی…………………………………………………………………………..18

 

2-9   مسائل بهینه سازی چندهدفه و روش های حل آن ها……………………………………………………………19

 

2-9-1   الگوریتم  NSGA-II……………………………………………………………..21

 

2-9-2   الگوریتم MOPSO  …………………………………………………………….22

 

2-9-2-1 ایده طراحی الگوریتم ……………………………………………………………………23

 

2-9-2-2 تشریح کلی الگوریتم……………………………………………………………………..24

 

2-9-3   روش محدودیت- Ԑ…………………………………………………………………….  …………………….26

 

2-10  بر تحقیقات مرتبط……………………………………………………………………27

 

2-12  جمع بندی……………………………………………………………………………………………………………..29

 

فصل سوم ،ارائه مدل پیشنهادی ………………………………………………………………31

 

3-1  مقدمه………………………………………………………………………………………………………………………..32

 

3-2   ویژگی های مدل…………………………………………………………………………………………………………34

 

3-3   مدل ریاضی مسئله………………………………………………………………………………………………………..34

 

3-3-1  معرفی اندیس­های مدل…………………………………………………………………………………..34

 

3-3-2  معرفی پارامترهای مدل…………………………………………………………………………………..34

 

3-3-3 معرفی متغیرهای تصمیم…………………………………………………………………………………..35

 

3-3-4 ارائه مدل برنامه­ریزی عددصحیح……………………………………………………………………..36

 

3-3-5  شرح محدودیت ها ……………………………………………………………………….37

 

فصل چهارم، ارائه روش حل و تحلیل آن……………………………………………………………39

 

4-1  مقدمه………………………………………………………………………………………………………………………..40

 

4-2  نتایج حل با روش دقیق محدودیت-Ԑ………………………………………………………………………………40

 

4-3  شرحی بر نحوه طراحی NSGA-II………………………………………………………………………………….41

 

4-3-1  عملکردچرخه ای…………………………………………………………………………..45

 

4-3-2  نخبه گرایی……………………………………………………………………………………45

 

4-3-3 تقاطع…………………………………………………………………………………………….47

 

4-3-4جهش……………………………………………………………………………………………47

 

4-3-5 شروط توقف………………………………………………………………………………………………..50

 

4- 4 شرحی بر نحوه طراحی   MOPS……………………………………..…………………………………………..51

 

4-5 اجرای الگوریتم­ها…………………………………………………………………………………………….52

 

4-5-1 نتایج سایز کوچک………………………………………………………………………………………..54

 

4-5-1-1 اندازه یک ونمونه یک……………………………………………………………………55

 

4-5-1-2 اندازه یک و نمونه دو…………………………………………………………………….55

 

4-5-1-3 اندازه یک و نمونه 3……………………………………………………………………….55

 

4-5-2 نتایج سایز متوسط………………………………………………………………………………………….57

 

4-5-2-1 اندازه 2 و نمونه 1………………………………………………………………………….57

 

4-5-2-2 اندازه 2 و نمونه 2………………………………………………………………………….58

 

4-5-2-3 اندازه 2 و نمونه 3………………………………………………………………………….60

 

              4 -5-3  نتایج سایز بزرگ……………………………………………………………………………………….60

 

4-5-3-1 اندازه 3 ونمونه 1…………………………………………………………………………..61

 

4-5-3-2 اندازه 3 و نمونه 2………………………………………………………………………….62

 

4-5-3-3 اندازه 3 و نمونه 3………………………………………………………………………….63

 

فصل پنجم، نتیجه گیری و پیشنهادات…………………………………………………………….64

 

5-1 نتیجه گیری…………………………………………………………………………………………………………………..65

 

5-2 پیشنهادات…………………………………………………………………………………………………………………….66

 

منابع…………………………………………………………………………………………………………………………………..67

 

 

 

فهرست جداول

 

جدول (2-1) چارلز داروین  ………………………………………………………………………………………………….16

 

جدول(2-2) گرگور مندل……………………………………………………………………………………………………..17

 

جدول(2-3) بر تحقیقات مرتبط…………………………………………………………………………………..27

 

جدول (3-1) فهرست اندیس های مدل…………………………………………………………………………………..34

 

جدول (3-2) فهرست پارامترهای مدل…………………………………………………………………………………….34

 

 

جدول (3-3)فهرست  متغیرهای عدد صحیح و غیر صحیح استفاده شد ه در مدلسازی………………………35

 

جدول(4-1) نتایج روش محدودیت-Ԑ…………………………………………………………………………………..41

 

جدول(4-2) تابع تجمعی………………………………………………………………………………………………………46

 

جدول(4-3) ترکیبات قابل استفاده…………………………………………………………………………………………50

 

جدول(4-5)  اندازه کوچک…………………………………………………………………………………………………54

 

جدول(4-6) اندازه متوسط…………………………………………………………………………………………………….58

 

جدول(4-7) سایز بزرگ………………………………………………………………………………………………………60

 

 

 

 

 

فهرست شکل­ها

 

شکل(2-1) حرکت پرندگان…………………………………………………………………………………………………25

 

شکل (4-1) نمایشی از کروموزوم شکل گرفته برای نگهداری تامین کننده هر قطعه…………………………42

 

شکل (4-2) ماتریس نگهدارنده اطلاعات توزیع محصولات بین فروشندگان مختلف……………………….42

 

شکل(4-3) ماتریس نگهدارنده اطلاعات توزیع قطعات یدکی بین فروشندگان متعلق به زنجیره………….43

 

شکل(4-4) نحوه تولید فرزندان از تقاطع …………………………………………………………………………………48

 

شکل(4-5)نمایش عملکرد الگوریتم‌ها در سایز اول نمونه 1…………………………………………………………56

 

شکل(4-6) نمایش عملکرد الگوریتم‌ها در سایز اول نمونه 2………………………………………………………..56

 

شکل(4-7) نمایش عملکرد الگوریتم‌ها در سایز اول نمونه 3………………………………………………………..57

 

شکل(4-8) نمایش عملکرد الگوریتم‌ها در سایز دو نمونه 1…………………………………………………………59

 

شکل(4-9) نمایش عملکرد الگوریتم‌ها در سایز دو نمونه 2…………………………………………………………59

 

شکل(4-10) نمایش عملکرد الگوریتم‌ها در سایز دو نمونه 3……………………………………………………….60

 

شکل(4-11) نمایش عملکرد الگوریتم‌ها در سایز سه نمونه 1……………………………………………………….62

 

شکل(4-12)نمایش عملکرد الگوریتم‌ها در سایز سه نمونه 2………………………………………………………..62

 

شکل(4-13) نمایش عملکرد الگوریتم‌ها در سایز سه نمونه 3………………………………….63
     

 

                         فصل اول

 

 

 

             مقدمه و کلیات تحقیق

 

1-1 مقدمه

 

در دنیای رقابتی امروز با توجه به ویژگیهای محیط های جدید تولیدی و طبیعت مشتریان، دیگر شیوه های مدیریت تولید گذشته كه یكپارچگی كمتری در فعالیتهایشان دنبال می كردند كارایی خود را از دست داده اند و امروزه شركتها نیاز دارند تا یكپارچگی منظمی را در تمام فعالیتهای تولیدی خود- از مواد خام تا مصرف كننده نهایی- ایجاد كنند[1].

 

همچنین  عنصری كه مهمترین نقش را در تجارت امروزی دارد شناسایی نیاز ها و خواسته های مشتریان است، که افزایش رضایت مشتری را در پی خواهد داشت. کیفیت نیز طبق تعریف بسیاری از منابع  هیچ معنا و مفهومی بجز هر آنچه که مشتری واقعا می خواهد، ندارد . به عبارت دیگر یک محصول زمانی با کیفیت است که با خواسته ها ونیازهای مشتری انطباق داشته باشد. کیفیت باید به عنوان انطباق محصول با انتظارات مشتری تعریف شود [2].

 

در نتیجه یكپارچه سازی زنجیره تامین با ارتباط با مشتری(دریافت بازخور و راضی نگهداشتن مشتری)چنان اهمیتی دارد که بخش گسترده ای از تصمیمات عملكردی در زنجیره تامین متاثر از اطلاعات ارائه شده توسط ارتباط با مشتر ی و در واقع بر پایه ی خواسته های خود مشتریان است و اجرای آن بیانگر  ایجاد یك زنجیره تامین مشتری مدار و به طبع آن بهبود کیفیت و برخورداری از جایگاهی شایسته در میان سایر رقبا خواهد بود.

 

 

 

1-5 كاربرد نانو مواد در سلولهای آلی.. 8

 

فصل 2 دینامیك مولكولی.. 11

 

2- 1شبیه سازی مولكولی.. 11

 

2-2 روش دینامیك مولكولی.. 13

 

2-3  اصول دینامیك مولكولی.. 14

 

2-4 شعاع قطع(Cut Off) 16

 

2-5 روش مجموع ایوالد (Ewald summation method) 18

 

2-6 اندازه‌گیری كمیتها در MD.. 18

 

2-7  مسیرها 19

 

2-8 نیروها 19

 

2-9 خواص استاتیك.. 23

 

2-10 خواص دینامیكی.. 24

 

2-11 کاربردها 26

 

2-12 محدودیت‌های MD.. 26

 

2-13  كدهای MD.. 26

 

فصل 3 شبیه سازی كوانتومی.. 28

 

3-1 آشنایی با محاسبات كوانتومی.. 28

 

3-2 روش هارتری.. 28

 

3-3  روش هارتری-فوك.. 30

 

3- 4 روشهای اختلال. 31

 

3-5 روشهای تابعی چگالی(DFT) 31

 

فصل 4 شبیه سازیها 34

 

1- محاسبه خواص ترمودینامیکی و ساختاری پلیمرها ومولكولهای سلولهای آلی خورشیدی.. 34

 

2- محاسبه خواص ترموینامیکی و ساختاری نانو لولهای كربنی و سایر نانو مواد. 36

 

3- محاسبه چسبش پلیمرها به دور نانو لولهای كربنی و سایر نانو مواد. 37

 

4-شبیه سازی جذب پلیمرها و نانو مواد به روی فلزات. 39

 

فصل 5 نوآوریها 40

 

فصل 1 سلولهای خورشیدی

 

 

اهداف فصل:اهمیت انرژی خورشیدی-انواع سلولهای خورشیدی-مواد آلی سلولهای خورشیدی-انواع سلولهای آلی-مشكلات سلولهای آلی-كاربرد نانو مواد در سلولهای آلی

 

1-1 منابع انرژی

 

امروزه یكی از مهمترین مشكلات بشر، مشكل انرژی است.مهمترین منابع انرژی امروزی،انرژی فسیلی از جمله نفت و گاز است. این منابع دارای مشكلاتی است از جمله تجدید ناپذیری ،آلودگی و گرمایش زمین . نمودار رشد منابع اولیه‌ی انرژی كل جهان(TPES)  از سال 1850 تا 2100 میلادی را در شكل 1-1 نشان داده شده.

 

 

 

 

 

 

 

 

شكل1-1رشد TPESجهان از سال 1850 تا 2100.]1[

 

مقدار TPES در سال 2004 میلادی در حدود 470 اتاژول بوده كه معادل 11.2 میلیارد تن نفت خام یا نزدیك به 80 میلیارد بشكه نفت خام می‌باشد. پیش‌بینی رشد TPES بسته به میزان رشد جمعیت و افزایش سطح رفاه در كل جهان بین 1.5 تا 2 درصد در سال است.قدرت آینده در دست كشورهای است كه به منابع جدید انرژی دسترسی داشته باشند.انرژی الکتریکی یکی از مهم ترین منابع انرژی است.برای تولید این انرژی روشهای مختلفی وجود دارد.امروزه یکی از ارزان ترین روشها استفاده از  سلولهای خورشیدی برای تولید این انرژی است. در جدول 1-1 سهم هر یك روشهای تولید برق در سال 2010 در آمریکا نشان داده شده.

 

 

 

 

 

 

 

2-2-آنتی‌بیوتک‌ها……………………………………………………………………………………………………………………….. 8

 

1-2-2- تعریف……………………………………………………………………………………………………………………………. 8

 

2-2-2-سابقه تاریخی………………………………………………………………………………………………………………….. 8

 

3-2-2-طبقه بندی آنتی‌بیوتیک ها…………………………………………………………………………………………… 9

 

4-2-2- استفاده از آنتی بیوتیک در حیوانات مولد غذا ………………………………………………………… 10

 

1-4-2-2-مصرف آنتی‌بیوتیک‌ها در طیور………………………………………………………………………………. 12

 

5-2-2- منشاء مقاومت به آنتی بیوتیک………………………………………………………………………………….. 15

 

6-2-2- مکانیسم های مقاومت به آنتی بیوتیک…………………………………………………………………….. 15

 

1-6-2-2- تغییر یا جایگزینی اهداف دارو……………………………………………………………………………… 16

 

2-6-2-2-غیرفعالسازی آنزیمی دارو……………………………………………………………………………………….. 16

 

عنوان                                                                                                                     صفحه

 

 

 

3-6-2-2- پمپ‌های خارج كننده دارو از سلول……………………………………………………………………… 17

 

4-6-2-2- کاهش جذب دارو………………………………………………………………………………………………….. 17

 

5-6-2-2- حفاظت از هدف…………………………………………………………………………………………………….. 18

 

6-6-2-2- بدام انداختن دارو………………………………………………………………………………………………….. 18

 

7-2-2- انتشار مقاومت به آنتی بیوتیک………………………………………………………………………………….. 19

 

1-7-2-2- وراثت عمودی………………………………………………………………………………………………………… 19

 

2-7-2-2- انتقال افقی……………………………………………………………………………………………………………… 20

 

8-2-2- مکانیسم‌های دخیل در انتقال افقی…………………………………………………………………………… 20

 

9-2-2- عناصر دخیل در انتقال افقی ژن های مقاومت…………………………………………………………. 21

 

1-9-2-2- پلاسمید‌ها………………………………………………………………………………………………………………. 21

 

2-9-2-2- ترانسپوزونها…………………………………………………………………………………………………………….. 22

 

3-9-2-2- اینتگرون‌ها……………………………………………………………………………………………………………… 23

 

10-2- ساختار و ویژگی‌های اینتگرون‌ها…………………………………………………………………………………. 23

 

1-10-2- کلاس 1 اینتگرون‌ها ………………………………………………………………………………………………. 24

 

2-10-2- کلاس 2  اینتگرون‌ها………………………………………………………………………………………………. 26

 

3-10-2- کلاس 3 اینتگرون‌ها……………………………………………………………………………………………….. 27

 

4-10-2- سوپر اینتگرون‌های کروموزومی یا کلاس4…………………………………………………………… 27

 

11-2-کاست ژنی………………………………………………………………………………………………………………………. 28

 

1-11-2- تعریف……………………………………………………………………………………………………………………….. 28

 

2-11-2- انتقال کاست‌های ژنی………………………………………………………………………………………………. 29

 

12-2- اپیدمیولوژی اینتگرون‌ها و بر شناسایی اینتگرون‌ها در ماکیان…………………….. 32

 

………………………………………………………………………………………………………………………………………………………….

 

 

 

 

 

 

 

عنوان                                                                                                                     صفحه

 

 

 

فصل سوم: مواد و روش کار

 

1-3- مواد و وسایل مورد نیاز……………………………………………………………………………………………………. 34

 

2-3- روش کار…………………………………………………………………………………………………………………………… 35

 

1-2-3- نمونه گیری…………………………………………………………………………………………………………………. 35

 

2-2-3- آزمون های تاییدی……………………………………………………………………………………………………… 36

 

3-2-3- آنتی‌بیوتیک‌های مورد استفاده برای آنتی‌بیوگرام …………………………………………………… 39

 

4-2-3- آزمون حساسیت آنتی بیوتیکی…………………………………………………………………………………. 40

 

5-2-3- روش ساخت نیم مک فارلند……………………………………………………………………………………… 41

 

6-2-3- نکات مورد توجه در انجام آزمایش آنتی بیوگرام……………………………………………………… 42

 

7-2-3- نکات مورد توجه در اندازه گیری قطر هاله و خواندن نتایج آزمایش آنتی بیوگرام. 43

 

8-2-3- بررسی حضور مقاومت های چند گانه……………………………………………………………………….. 43

 

9-2-3- استخراج DNA جهت انجام آزمایشهای مولکولی …………………………………………………… 44

 

10-2-3- انجام واکنش های زنجیره ای پلیمراز…………………………………………………………………….. 50

 

11-2-3- انجام واکنش PCR برای شناسایی ژن های اینتگراز 1 و 2……………………………….. 52

 

 

12-2-3- الکتروفورز روی ژل آگارز…………………………………………………………………………………………. 53

 

13-2-3- شناسایی کاست ژنی اینتگرون……………………………………………………………………………….. 54

 

14-2-3- انجام واکنش PCR برای شناسایی کاست‌های ژنی اینتگرون کلاس 1……………… 55

 

15-2-3- تعیین ترادف محصولات………………………………………………………………………………………….. 56

 

16-2-3- آزمون آماری…………………………………………………………………………………………………………….. 56

 

 

 

 

فصل چهارم: نتایج

 

1-4 نتایج جستجوی اینتگرونهای کلاس 1 و 2…………………………………………………………………….. 57

 

2-4 نتایج بررسی کاست ژنی کلاس 1 اینتگرون‌ها……………………………………………………………….. 63

 

3-4 نتایج تعیین توالی کاست‌ ژنی کلاس 1 اینتگرون‌ها………………………………………………………. 65

 

 

 

 

عنوان                                                                                                                     صفحه

 

 

 

 

فصل پنجم: بحث و نتیجه گیری…………………………………………………………………………………………… 67

 

 

 

فهرست منابع……………………………………………………………………………………………………………………………. 75

 

 

 

پیوست ………………………………………………………………………………………………………………………………………. 89

 

فهرست جداول

 

 

 

 

 

عنوان                                                                                                                     صفحه

 

 

 

 

جدول1-1: طبقه بندی آنتی‌بیوتیک‌ها بر اساس مکانیسم اثر ………………………………………………. 10

 

جدول 1-3: دستگاه­ها وسائل آزمایشگاهی مورد استفاده……………………………………………………….. 34

 

جدول 2-3: مواد شیمیایی مورد استفاده…………………………………………………………………………………. 35

 

جدول 3-3: آنتی‌بیوتیک‌های استفاده شده برای آنتی‌بیوگرام……………………………………………….. 39

 

جدول4-3: دیسک‌های آنتی‌بیوتیک استفاده شده، مقادیر ماده موثره آن‌ها

 

و تفسیر نتایج آزمایش حساسیت آنتی‌بیوتیکی ………………………………………………………………………. 41

 

جدول 5-3: خصوصیات روش آزمایش آنتی بیوگرام (دیسک دیفیوژن)

 

بر اساس معیارهای  CLSI (NCCLS)…………………………………………………………………………………… 42

 

جدول 6-3: اطلاعات  نمونه های کارشده ، گرفته شده  از مزارع گوشتی

 

شهرستان شیراز…………………………………………………………………………………………………………………………. 45

 

جدول 7-3: برنامه چرخه حرارتی PCR برای شناسایی ژن های اینتگراز 1 واینتگراز 2…… 50

 

جدول 8-3: برنامه چرخه حرارتی  PCR برای شناسایی کاست ژنی اینتگرون کلاس1 …… 50

 

جدول9-3: مشخصات مربوط به پرایمرهای مورد استفاده برای شناسایی ژن های

 

اینتگراز 1 و اینتگراز 2……………………………………………………………………………………………………………… 51

 

جدول10-3: مشخصات مربوط به پرایمرهای مورد استفاده برای شناسایی کاست ژنی

 

اینتگرون کلاس 1………………………………………………………………………………………………………………………. 51

 

جدول11-3: غلظت استوک مواد اولیه مورد استفاده در واکنش زنجیره­ای پلیمراز…………….. 51

 

جدول 12-3: ساخت محلول کار آماده جهت انجام Multiplex PCR برای شناسایی

 

ژنهای اینتگراز…………………………………………………………………………………………………………………………….. 52

 

عنوان                                                                                                                     صفحه

 

 

 

 

جدول 13-3: تهیه بافر TAE 50 بار………………………………………………………………………………………. 53

 

جدول14-3: ساخت محلول کار آماده جهت انجام  PCR برای شناسایی کاست ژنی

 

کلاس1 اینتگرون………………………………………………………………………………………………………………………. 55

 

جدول 1-4: مقاومت های چندگانه آنتی بیوتیکی در جدایه های اشریشیا کولی

 

بدست آمده از مراحل مختلف نمونه گیری در گله های گوشتی اطراف شیراز…………………….. 58

 

جدول 2-4: تعداد (درصد) موارد مثبت و منفی ژن اینتگراز1 در جدایه های E. coli

 

جداشده در سه مرحله مختلف از جوجه های گوشتی……………………………………………………………. 59

 

جدول 3-4: تعداد (درصد) موارد مثبت و منفی ژن اینتگراز2 در جدایه های E. coli

 

جداشده در سه مرحله مختلف از جوجه های گوشتی……………………………………………………………. 60

 

جدول 4-4: تعداد (درصد) موارد مثبت و منفی حضور همزمان ژنهای اینتگراز 1 و 2

 

در جدایه های E. coli  جداشده در سه مرحله مختلف از جوجه های گوشتی……………………. 61

 

جدول 5-4: تعداد (درصد) موارد مثبت و منفی ژن اینتگراز1 و ژن اینتگراز2 و حضور

 

همزمان هر دو ژن اینتگراز در تمام جدایه های E. coli  مورد بررسی در این مطالعه…………. 62

 

جدول 6-4: کد نمونه، طول کاست ژنی و ژنهای موجود در کاست ژنی

 

کلاس 1 اینتگرون‌ها در محصولات PCR تعیین ترادف شده…………………………………………………. 66

 

فهرست تصاویر

 

 

 

 

 

عنوان                                                                                                                     صفحه

 

 

 

 

تصویر 1-1 مکانیزم های توسعه مقاومت به آنتی بیوتیک  …………………………………………………… 19

 

تصویر 2-1 سه مکانیسم اصلی که توسط آن ژن های مقاومت آنتی بیوتیکی

 

به صورت افقی در میان باکتری ها منتقل می‌شوند ………………………………………………………………. 21

 

تصویر3-1) ساختمان کلی یک اینتگرون ………………………………………………………………………………… 24

 

تصویر4-1: ساختمان کلی کلاس1 اینتگرون‌ها ……………………………………………………………………… 25

 

تصویر 5-1: ساختار کلاس 1 اینتگرون‌ یافت شده در Tn402……………………………………………….. 26

 

تصویر6-1: ساختار اینتگرون کلاس2 موجود در Tn7 …………………………………………………………… 26

 

تصویر7-1: ساختار اولین اینتگرون کلاس 3 از ژاپن …………………………………………………………….. 27

 

تصویر8-1: ساختار کاستها همراه اینتگرون ……………………………………………………………………………. 28

 

تصویر8-1:ساختار شماتیک کاست وارد شده به اینتگرون ……………………………………………………. 29

 

تصویر9-1: مکانیسم ورود و بیان کاست‌های ژنی توسط اینتگرون کلاس1 ……………………………………………………………………………………………………………………………………………………… 31

 

تصویر1-4: تصوی ژل الکتروفورز……………………………………………………………………………………………….. 63

 

تصویر 2-4: الگوی باند‌های محصولات PCR کاست ژنی کلاس 1 اینتگرون‌ها

 

با طول متفاوت پس از الکتروفورز روی ژل آگارز……………………………………………………………………… 64

 

تصویر 3-4: الگوی باند‌های محصولات PCR کاست ژنی کلاس 1 اینتگرون‌ها

 

با طول متفاوت پس از از الکتروفورز روی ژل آگارز………………………………………………………………….. 65

 

فهرست نمودارها

 

 

 

 

 

عنوان                                                                                                                     صفحه

 

 

 

 

نمودار1-4: درصد مقاومت های چندگانه آنتی بیوتیکی در جدایه های اشریشیا کولی

 

بدست آمده از مراحل مختلف نمونه گیری در گله های گوشتی اطراف شیراز……………………. 58

 

نمودار 2-4: نمودار درصد موارد مثبت و منفی ژن اینتگراز 1 در جدایه های E. coli

 

بدست آمده طی مراحل مختلف نمونه‌گیری در این مطالعه……………………………………………………. 59

 

TSI: Triple Sugar Iron Agar

 

MR-VP: Methyl Red-voges Prokouer Medium

 

MRSA: Methicillin resistant staphylococcus

 

PBP: Penicillin Binding Protein

 

ICU: Intensive Care Unit

 

KDa: Kilo Daltone

 

فهرست مطالب

 

عنوان                                                                                                                          صفحه

 

فصل اول: مقدمه و مروری بر مطالعات مشابه. 1

 

1-1- انتروباکتریاسه. 2

 

1-2- کلبسیلا.. 2

 

1-3- تاریخچه. 2

 

1-4- بیماری زایی کلبسیلا.. 2

 

1-5- محل میکروب کلبسیلا.. 3

 

. 5

 

1-7- تشخیص آزمایشگاهی کلبسیلا پنمونیه. 7

 

1-8- درمان و پیشگیری کلبسیلا پنمونیه. 8

 

1-9- طبقه بندی آنتی بیوتیک‌ها 9

 

1-10- آنتی بیوتیکهای-β  لاکتام. 9

 

1-11- پنی سیلین‌ها 10

 

1-12- سفالوسپورین‌ها و سفامایسین‌ها 11

 

1-13- کارباپنم‌ها 12

 

1-14- آنتی بیوتیک‌های -β لاکتام دیگر. 13

 

1-14-1- آنتی بیوتیک‌های -β لاکتام منوسیکلیک…. 13

 

1-14-1-1- مکانیسم عمل آنتی بیوتیک‌های-β لاکتام. 14

 

1-14-2- مکانیسم عمل سفالوسپورین‌ها 14

 

1-14-3- مکانیسم عمل کارباپنم‌ها 15

 

1-14-4- مکانیسم عمل –β لاکتام‌های منوسیکلیک…. 16

 

1-14-4-1- مکانیسم مقاومت نسبت به آنتی بیوتیک‌های–β لاکتام. 16

 

1-14-4-2- مکانیسم مقاومت نسبت به سفالوسپورین‌ها 17

 

1-14-4-3- مکانیسم مقاومت نسبت به آنتی بیوتیک‌های–βلاكتام منوسیکلیک…. 17

 

1-14-4-4- مکانیسم مقاومت نسبت به کارباپنم‌ها 18

 

1-14-5- مهار کنندگان  –βلاكتاماز 19

 

1-14-6- مکانیسم عمل مهار کننده‌های–βلاكتاماز 19

 

1-14-7- بتالاکتامازهای وسیع الطیف(ESBLs) 20

 

1-14-7- تاریخچه مختصر بتالاکتامازها 20

 

1-14-8- انواع بتالاکتامازها 21

 

1-15- روش تشخیص…. 25

 

بر مطالعات گذشته. 25

 

فصل دوم: مواد و روش‌ها 28

 

2-1- بیان مسئله. 29

 

2-2- اهداف… 32

 

2-2-1- اهداف اصلی طرح.. 32

 

2-2-2- اهداف ویژه طرح.. 32

 

2-3- سؤالات و فرضیات… 33

 

2-4- نوع و روش مطالعه. 33

 

2-5- روش کار 34

 

2-5-1- محیط مورد استفاده جهت کشت باکتری.. 34

 

2-5-2- محیط کشت‌های مورد استفاده جهت تعیین هویت باکتری.. 34

 

2-5-3- محیط کشت TSI(Triple Sugar iron agar) 37

 

2-5-4- محیط اوره(Urea agar) 38

 

2-5-5- محیط کشت مورد استفاده جهت تعیین ESBLs و سنجش حساسیت باکتری‌ها نسبت به آنتی بیوتیک‌ها: 38

 

2-6- روش اجرای کار 39

 

 

2-6-1- جمع آوری نمونه‌ها 39

 

2-6-2- سنجش حساسیت باکتری نسبت به آنتی بیوتیک‌ها 39

 

2-7- آنالیز آماری.. 40

 

2-8- محدودیت و مشکلات اجرایی طرح.. 41

 

2-9- متغیرها 41

 

فصل سوم: یافته‌ها 42

 

3-1- نتایج.. 43

 

فصل چهارم: بحث، نتیجه گیری و پیشنهادات… 66

 

4-1- بحث… 67

 

4-2- نتیجه گیری.. 73

 

4-3- پیشنهادات… 73

 

Abstract.. 74

 

فهرست مراجع.. 75

 

ضمیمه: پرسشنامه. 83

 

فهرست جدول‌ها

 

عنوان                                                                                                                          صفحه

 

جدول 1-1- سفالوسپورین‌ها 12

 

جدول 1-2- طبقه بندی انزیم‌های بتالاکتاماز [11] 23

 

جدول 3-1- فراوانی نسبی آنزیم آنزیم بتالاکتاماز با طیف گسترش یافته در نمونه‌های مورد بررسی به روش Double Disk Synergy Test 49

 

جدول 3-2- فراوانی نسبی آنزیم ESBLs در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب نوع نمونه. 50

 

جدول 3-3- فراوانی نسبی آنزیم ESBLs در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب نوع بخش…. 51

 

جدول 3-4- فراوانی نسبی آنزیم ESBLs در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب سن.. 52

 

جدول 3-5- فراوانی نسبی آنزیم ESBLs در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب جنس…. 53

 

به آنتی بیوتیک‌های مختلف به روش دیسک دیفیوژن  54

 

جدول 3-7- فراوانی نسبی آنزیم ESBLs در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب مقاومت به جنتامایسین  55

 

جدول 3-8- فراوانی نسبی آنزیم ESBLs در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب مقاومت به کوتیموکسازول  56

 

جدول 3-9- فراوانی نسبی آنزیم ESBLs در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب مقاومت به آمپی سیلین  57

 

جدول 3-10- فراوانی نسبی آنزیم ESBLs در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب مقاومت به سیپروفلوکساسین  58

 

جدول 3-11- فراوانی نسبی آنزیم ESBLs در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب مقاومت به پیپراسیلین  59

 

جدول 3-12- فراوانی نسبی آنزیم ESBLs در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب مقاومت به سفوتاکسیم  60

 

جدول 3-13- فراوانی نسبی آنزیم ESBLs در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب مقاومت به سفپیم.. 61

 

جدول 3-14- فراوانی نسبی آنزیم ESBLs در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب مقاومت به آموکسی سیلین/کلاولانات   62

 

جدول 3-15- فراوانی نسبی آنزیم ESBLs در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب مقاومت به سفتازیدیم  63

 

جدول 3-16- فراوانی نسبی آنزیم ESBLs در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب مقاومت به ایمی پنم.. 64

 

فهرست شكل‌ها

 

عنوان                                                                                                                          صفحه

 

شكل 3-1- نتایج آزمایش combination disk جهت تشخیص ESBLs 65

 

انتروباکتریاسه

 

انتروباکتریاسه‌ها بزرگترین مجموعه ناهمگون از باسیل‌های گرم منفی در پزشکی می باشند که حدود 40 جنس و 150 گونه از آنها شناسایی شده است. این مجموعه به عنوان قسمتی از فلور نرمال روده ای بیشتر حیوانات و انسان‌ها هستند. این باکتری‌ها در انسان مسئول 30 تا 35 درصد از سپتی سمی‌ها، بیش از 70 درصد از عفونت‌های ادراری و بسیاری از عفونت‌های روده ای می باشند. بعضی از انواع آن‌ها شامل E.Coli، Klebsiella ، Proteus ، Salmonella و Shigella میباشد. تمامی اعضای گروه انتروباکتریاسه در شرایط هوازی و بی هوازی رشد می‌کنند[1].

 

MIC: Minimum Inhibitory Concentration

 

ANT: Aminoglycoside Nucleotidyl transferase

 

VIM: Veronese Imipenemase

 

IMP: Imipenemase

 

NDM: New Delhi Methalo Beta Lactamases

 

GIM: Germany Imipenemase

 

SPM: Sao Paulo metallo-beta-lactamase

 

SIM-1: Seoul Imipenemase

 

KDa: Kilo Daltone

 

MR-VP: Methyl Red-voges Prokouer Medium

 

OF: Oxidative Fermentative

 

TSI: Triple Sugar Iron Agar

 

SIM: Sulfide-Indol Motility

 

EMB: Eosin methylene-blue agar

 

PCR: Polymerase Chain Reaction

 

OF: Oxidative Fermentative

 

TSI: Triple Sugar Iron Agar

 

SIM: Sulfide-Indol-Motility

 

 

 

 

 

فهرست مطالب

 

عنوان                                                                                                                          صفحه

 

فصل اول: مقدمه و مروری بر مطالعات مشابه. 1

 

1-1- خانواده پسود و موناداسه آ 2

 

1-2- تاریخچه P. aeruginosa. 3

 

1-2-1- خصوصیات مورفولوژیک P. aeruginosa. 5

 

1-2-2- خصوصیات رشد. 5

 

1-2-3- هوازی‌های اجباریObligate aerobes 5

 

1-2-4- مشخصات کشت… 6

 

1-2-5- مواد آلی مورد نیاز 7

 

1-2-6- محیط‌های کشت… 8

 

1-2-7- پیگمان.. 9

 

1-2-8- شاخص‌های بیماریزایی در P. aeruginosa. 11

 

1-2-8-1- پیلی(Pili) 11

 

1-2-8-2- آلژینات (Alginate) 12

 

1-2-8-3- اندوتوکسین.. 12

 

1-2-8-4- پروتئاز‌های خارج سلولی.. 13

 

1-2-8-5- همولیزین‌ها 15

 

1-2-8-6- فسفولیپاز ‍C. 15

 

1-2-8-7- رامنولیپیدها 15

 

1-2-9- توکسین‌های خارج سلولی.. 16

 

1-2-9-1- اگزوتوکسینA. 16

 

1-2-9-2- اگزوآنزیم S. 16

 

1-2-10- لوکوسیدین با وزن ملکولی بالا. 17

 

1-2-11- سیدروفورها 17

 

1-2-12- لیپاز 17

 

1-2-13- سیتوتوکسین 18

 

1-2-14- پایوسیانین       18

 

1-2-15- سیستم ترشحی نوع III 18

 

1-2-16- اپیدمیولوژی.. 19

 

1-2-17- بیماریهای ناشی از P. aeruginosa. 20

 

1-2-17-1- باکتریمی.. 20

 

1-2-17-2- عفونت‌های گوش…. 20

 

 

1-2-17-3- عفونت‌های چشم.. 21

 

1-2-17-4- عفونت‌های مجرای تنفسی.. 21

 

1-2-17-5- عفونت‌های استخوان و مفصل.. 22

 

1-2-17-6- عفونت‌های سیستم عصبی مرکزی.. 22

 

1-2-17-7- عفونت‌های دستگاه گوارش…. 22

 

1-2-17-8- عفونت‌های پوست و بافت نرم. 23

 

1-2-17-9- عفونت‌های دستگاه ادارای.. 24

 

1-2-17-10- باکتریمی.. 24

 

1-2-17-11- عفونتهای استخوان و مفصل.. 24

 

1-2-17-12- عفونت‌های سیستم عصبی مرکزی.. 24

 

1-2-17-13- اندوکاردیت عفونی.. 25

 

1-2-17-14- عفونت‌های مجرای تنفسی.. 25

 

1-2-17-15- عفونت پوست و بافت‌های نرم. 26

 

1-2-17-16- عفونت‌های ادراری.. 26

 

1-2-18- متالوبتالاکتاماز 27

 

1-2-19- شیوع مقاومت متالوبتالاکتامازها 27

 

1-2-20- انواع  تیپ‌های متالوبتالاکتاماز 28

 

1-2-21- The Imipenemase(IMP) Type 28

 

1-2-22- The Veronese Imipenemase (VIM) Type 28

 

1-2-23- New Delhi Metalo β-lactamase-1 (NDM-1) Type 28

 

1-2-24-  دیگر تیپ‌های متالوبتالاکتاماز 29

 

1-2-24-1- روش‌های تشخیص متالوبتالاکتاماز 29

 

1-2-24-2- سنجس حساسیت) آنتی بیوگرام) 29

 

1-2-24-3- روش E.Test به وسیله نوار    MBL. 30

 

بر مطالعات گذشته. 31

 

فصل دوم: مواد و روش‌ها 34

 

2-1 بیان مسئله و اهمیت موضوع. 35

 

2-2- اهداف… 36

 

2-2-1- اهداف اصلی طرح.. 36

 

2-2-2- اهداف ویژه طرح.. 36

 

2-3- سؤالات و فرضیات… 36

 

2-4- نوع و روش مطالعه. 37

 

2-5- روش کار 37

 

2-5-1- انواع محیط کشت… 37

 

2-5-2- مکانکی آگار(Mac Conkey agar) 37

 

2-5-3- محیط کشت  SIM.. 38

 

2-5-4- روش آماده سازی معرف کواکس جهت تست اندول.. 39

 

2-5-5- محیط کشت OF. 39

 

2-5-6- محیط کشت TSI 39

 

2-5-7- محیط سیمون سیترات… 40

 

2-5-8- محیط مایع( ( MR-VP. 40

 

2-5-9- طرز تهیه معرف VP. 41

 

2-5-10- طرز تهیه معرف MR. 41

 

2-5-11- تست اکسیداز 41

 

2-6- روش اجرای کار 42

 

2-6-1- جمع آوری نمونه‌ها 42

 

2-6-2- تعیین آنزیم متالوبتالاکتاماز 43

 

2-6-3- آنالیز آماری.. 44

 

2-6-4- محدودیت و مشکلات اجرایی طرح.. 44

 

2-7- جدول متغیرها 45

 

فصل سوم: یافته‌ها 46

 

3-1- نتایج.. 47

 

فصل چهارم: بحث، نتیجه گیری و پیشنهادات… 69

 

4-1- بحث… 70

 

4-2- نتیجه گیری.. 75

 

4-3- پیشنهادات… 75

 

Abstract. 76

 

فهرست مراجع.. 77

 

ضمیمه: پرسشنامه. 84

 

 

 

فهرست جدول‌ها

 

عنوان                                                                                                                          صفحه

 

جدول1-1- طبقه بندی بعضی از جنس‌های  خانواده پسودوموناسه آ که از نظر طبی اهمیت دارند [5]. 3

 

جدول 3-1- فراوانی نسبی آنزیم متالوبتالاکتاماز در نمونه‌های مورد بررسی به روش E.Test 52

 

جدول 3-2- فراوانی نسبی آنزیم MBL در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب نوع نمونه. 53

 

جدول 3-3- فراوانی نسبی آنزیم MBL در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب بخش…. 54

 

جدول 3-4- فراوانی نسبی آنزیم MBL در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب سن.. 55

 

جدول 3-5- فراوانی نسبی آنزیم MBL در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب جنس…. 56

 

جدول 3-6- فراوانی نسبی مقاومت سویه‌های سودوموناس ائروژینوزا به آنتی بیوتیک‌های مختلف به روش دیسک دیفیوژن  57

 

جدول 3-7- فراوانی نسبی آنزیم MBL در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب مقاومت به جنتامایسین.. 58

 

جدول 3-8- فراوانی نسبی آنزیم MBL در نمونه‌های مورد بررسی بر حسب مقاومت به کوتریموکسازول  59